不過這種原本是配合朝廷的分化手段，用來限製和解決藩鎮問題的底牌，卻被大張旗鼓的用來對付我的龍武軍，我真不知道該是悲哀還是榮幸。
要知道整個長安附近周邊的駐軍，幾乎被卷入這場針對龍武軍的動亂中，兩大領兵的宗王，兩鎮節度使，南北衙，駐留城外的外鎮軍在內，十幾支軍一級的部隊，幾乎遭到了毀滅性打擊，作為朝廷直屬中軍十六衛裏，勢力最完好的七個衛的編製徹底消失。同時還有大量的朝臣和官吏的家宅，被亂兵劫掠或搗毀，
但是很奇怪的一個事情，雖然那些閹黨是因為陛下病危才臨機發動的，但是那些外軍卻象是早有默契一般，按照遠近的距離，幾乎是同時發兵攻入長安，但是進了長安後的表現，卻讓人大跌眼鏡，這些軍隊徹底失去了有效的控製。
然後是重新評定這些軍隊的戰備等級和規模戰鬥力，以決定相應的配給製度和待遇級別，以及去留撤並還是整編。
在整頓的同時，也籍以在朝廷中軍，在朝廷直屬的中軍，和關內駐軍中，進行龍武軍特色的三差一選一材製度的拓展試點，推行龍武軍中沿用相對成熟的軍勳等階製度，以區於別外軍，形成軍職銜爵的雙軌製度。職務和軍銜徹底分開管理，薪餉和津貼、犒賞、年賜、月供、衣料等名目也徹底區分開來，以減少過手的環節和層次。
所謂三差製度，在營以上由中軍派遣隨行參軍，以備參佐；在團以上由法曹派遣的軍法虞侯，以糾檢風紀；在隊上差遣以武學出身的見習士官為領副。
一選就是，在火以下，讓士兵自選管理飲食的專人，比同火副算是半個官，也算是的自治精神，龍武軍的食料和餉錢是分開管理的，中間盡量減少過手的環節。
一材，就是材官製度，顧名思義就司材之官，鑒於龍武軍的新式裝備名目繁多，在戰場上的軍械消耗很大，而產生一些兵備保養不善的問題，而特地創立的，相當於後世的槍炮軍士，由軍器監派遣或培訓專門的人員，在團、隊一級，對各種器械的使用維護包養修繕，進行指導。平時軍屬的匠戶營所轄修造所進行管理。
三差一選一材的體製，在長安的亂戰中發揮了難以想象的作用，由於是突然襲擊，許多營團直接被突如其來的敵人，分割成若幹各集團各自為戰，一些主官校尉接戰沒多久就戰死，這時候副尉繼續指揮，副尉也陣亡，由軍法官按照序列接替指揮，軍法官陣亡後，參佐官繼續指揮，參佐官陣亡，材官接任，團屬主官、差遣官、材官全部戰死，則由次一級的首席老兵隊隊正接手。。。
因此，哪怕損失了幾乎所有負責指揮的軍頭，殘餘的部隊還能夠忙而不亂的繼續戰鬥上很長一段時間，直到脫離戰鬥，因此大多數建製都得以保存下來。
在外軍，則推行五兵輪邊製度，但凡設計邊防關要之所在，由定期輪換的少量禁軍、部分衛軍，配合本地邊軍進行協守，在節度使的本鎮治所，則由節鎮的牙兵，衛軍、地方守捉或團練兵，構成三極戰備層次，以達到相互檢視的目的，減少變亂或是尾大不掉的風險。
相對中軍的大換血，除了被整頓的關內和隴右兩大節度使，其他大部分外軍還是沿襲了傳統的監軍製度，隻不過變成內官、禦史的雙軌製，內官負責與朝廷的聯絡，和定期報告將領的言行，隨軍禦史又稱察官，則負責糾檢軍中風紀。不過隨著由武學培訓各道推薦來的將校士官，陸續發還本鎮後，其中某些人還將當負起眼線和報告的任務。
至少在加強對軍隊的控製，或是削弱外軍中個人色彩和山頭主義的影響，加強朝廷的中央集權上，無論是新子還是列位宰輔，對我在大多數措施的態度上，多是比較接近的讚同態度或者是默許的立場，所差別的知識行事的態度和方式。。
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