他這隱隱的意思，就是說鄭芝龍失職。
但崇禎皇帝見了，卻並沒有做出他所希望的事情，反而回答道：“無妨，回頭發出告示，曉瑜天下，並傳南洋，宣布紅夷總督之罪責，我大明誓必將所有在大明犯罪之紅夷，繩之於法。”
這其實也就是“犯大明天威者，雖遠必誅！”的海上版本，台灣的紅夷，老巢被端，主力被殲，已經是達到了作戰目標。而逃走的三艏戰船，又剛好成了大明以後出兵南洋的借口之一，這種情況，對於目標長遠的崇禎皇帝來說，其實是樂見其成的。
幾天以後，朝廷宣布在台灣設縣，在島上的所有逃民，凡自覺在限期內往縣治所在登記造冊，則往事一律不再追究。如果是換了以前，官府貿然登岸，宣布這策的話，怕是會引來逃民的反抗。可經過了紅夷的事情後，島上的逃民，已經深深地知道了一個道理，官府雖然收稅，卻能保護他們。如果沒有了官府，他們隻是待宰的羔羊而已。有了陳明等人的現身說法，朝廷在台灣設縣治的事兒，推進地非常順利。
於是，在福建巡撫的管轄下，又正兒八經地多了一個台灣縣。
至此，大明東南沿海，海盜都逃亡南洋，幾乎絕跡，而紅夷也被大明水師殲滅，剩下的海上武裝力量，在澳門的佛郎機人，在見證了大明的水師力量，見證了紅夷的下場之後，表現得很乖！
於是，李芝奇的登萊水師，在南洋返航的糧船到達之後，就護送著糧船返回北方。
在這其中，台灣一戰，論功行賞，有鄭芝龍的人擔任了登萊水師中的中級官職，也有李芝奇的手下擔任了福建水師中的中級官職，互有混雜。任何人一看就知道，這是朝廷防止一家獨大，混編起來有利於控製。對於李芝奇和鄭芝龍來說，他們肯定是不希望這樣的。可朝廷這麽做，他們也沒有辦法。更何況，在兩個死對頭的身邊，都有對方最親近的人跟著。平日裏如果想憑借手中權勢刁難那些混調過來的人，也不會那麽容易。對於這種情況，也隻能是認了。
解決了大明東南沿海的海盜問題，三省總督孫傳庭的奏報中，明顯提到了大明海商在增加，海稅的收入，又開始突飛猛進的事情。這讓崇禎皇帝很是高興，隨著時間的推移，相信參與海貿的人，還會更多。開海一事，進入了良性循環。接下來，澳門的葡萄牙人表現得還乖順，就暫時先放過他們。先行發展水師，等水師足夠強大之後再說了。
崇禎皇帝想完這些，就拿起禦案上放著的一本奏章，又再次看了起來。這份奏章很厚，是錦衣衛指揮使劉興祚遞上來的。回頭他又拿起另外一本奏章，這是東廠提督王承恩遞上來的。
崇禎皇帝兩本放開，各自查看了一番之後，心中做出了決定，抬頭對身邊的輪值太監吩咐道：“傳劉興祚、王承恩覲見！” 本章已閱讀完畢(請點擊下一章繼續閱讀!)